Η διοίκηση του νοσοκομείου αποτελεί τον βασικό πυλώνα οργάνωσης, συντονισμού και εύρυθμης λειτουργίας όλων των υπηρεσιών του ιδρύματος. Με επικεφαλής τον Διοικητή και σε συνεργασία με τα μέλη του Διοικητικού Συμβουλίου, η διοίκηση φροντίζει για τη στρατηγική ανάπτυξη του νοσοκομείου, τη σωστή κατανομή των πόρων, την τήρηση των κανόνων λειτουργίας και την εφαρμογή του θεσμικού πλαισίου της δημόσιας υγείας. Παράλληλα, διασφαλίζει τη διαφάνεια, την ποιότητα στις παρεχόμενες υπηρεσίες και τη συνεχή βελτίωση των παρεμβάσεων προς όφελος των ασθενών και του προσωπικού. Μέσα από συνεργασία με τις ιατρικές, νοσηλευτικές και διοικητικές υπηρεσίες, η διοίκηση συμβάλλει ενεργά στην εκπλήρωση του κοινωνικού και υγειονομικού ρόλου του νοσοκομείου.